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儘管穆斯林迅速控制了大部分肥沃的土地，但他們仍然是一個明顯的少數群體。
基督教社群保持了較大程度的自治，但整個奧斯曼時期都標誌著基督教人口從平原遷往山區的現象。
這導致了山中強盜和叛亂者的興起，同時相應地設立了由政府資助的阿馬託洛伊（armatoloi，武裝部隊）以制止強盜的活動。
隨著1683年“偉大的土耳其戰爭”的爆發，威尼斯在弗朗西斯科·莫羅西尼（Francesco Morosini）指揮下於1687年佔領了整個半島，並在1699年的卡爾洛維茨條約（Treaty of Karlowitz）中得到了奧斯曼帝國的承認。
威尼斯將其省份建立為“伯羅奔尼撒王國”（義大利語：Regno di Morea），但他們的統治並不受歡迎。
當奧斯曼帝國在1715年再次入侵半島時，大多數當地希臘人對他們表示歡迎。
奧斯曼的再征服過程迅速而容易，威尼斯在1718年的帕薩羅維茨條約（Treaty of Passarowitz）中承認了這一點。
伯羅奔尼撒半島現在成為了摩里亞艾亞列（Morea Eyalet）的核心，由摩拉維阿利（Mora valesi）領導，直到1780年他是一級帕夏（pasha，擁有三條馬尾）並擔任維齊爾（vizier）職務。
1780年後直到希臘獨立戰爭，省長由一位穆哈西爾（muhassil）擔任。
摩里亞的帕夏由幾位下屬官員協助，包括一名基督教翻譯（dragoman），他是該省的高階基督教官員。
與第一次奧斯曼統治時期一樣，摩里亞被劃分為22個區或貝伊利克（beyliks）。
首府最初設在納夫普利翁（Nauplion），但在1786年後遷至特里波利察（Tripolitza）。
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伯羅奔尼撒半島的希臘人在俄羅斯的支援下於1770年發起了所謂的“奧爾洛夫起義”，但這一行動很快被奧斯曼僱傭的穆斯林阿爾巴尼亞僱傭軍迅速而殘酷地鎮壓。
當地希臘人稱這些部隊為“土耳其-阿爾巴尼亞人”，他們在1769年至1770年期間的起義中也摧毀了埃皮魯斯（Epirus）許多城市和城鎮。
伯羅奔尼撒半島在隨後的幾十年裡，遭受了來自不規則阿爾巴尼亞幫派的嚴重侵害，損失遠超
