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突發事件！
一隻幼年體數碼寶貝破殼不到十分鐘，忽然離奇死亡。
幾乎是同一時間，千穆和江戶川柯南反應極快，各自衝到一臺電腦前，而剛還頂著麻木臉的江戶川柯南竟比千穆還振奮，想也不想就大喊一聲：“別動，保護好現場！”
“！”
螢幕上的Q版亞古獸博士嚇了一跳，趕忙縮回邁進房間一厘米的腳掌，乖乖站在門口。
五臺電腦連線的是同一所電子培育所，此時，螢幕上呈現的畫面都是相同的。
然而電腦已經失陷兩臺，等少年偵探團懵逼幾秒，回過神來急著搶佔剩下的圍觀機會時，好傢伙，又一個不愛幼的大人無恥地搶走了本該給小孩子的電腦。
安室透只比前兩個人慢了一步，因為剎那間想到，數碼寶貝還能出死亡事件真就……離譜，總感覺有哪裡怪怪的。
但原因不明，安室透只能壓下怪異，套上私人偵探的人設進入推理模式，被撇開的小鬼們加阿笠博士只能分成兩撥，擠在一起審視死亡現場。
很快，在場的假偵探真偵探堪比X光的視線掃過，迅速總結出基本情況。
地點：以白色為基調的房間，從井井有條卻隨處可見的資料夾檔案袋可判斷，這是一間辦公室。
死者：一隻有著狗狗般的長耳朵和堅硬的尖角，身體卻類似果凍，下半身組織飄忽不成型的幼年體數碼寶貝。
據現場第一發現者亞古獸博士阿古的證詞，案發前它離開了孵化室一小會兒，回來後發現數碼蛋已提前孵化，但孵化出的數碼寶貝卻不見了三隻。
阿古前去各房間尋找，在經過培育所主人阿源的辦公室時，突然聽到辦公室內的尖叫聲，當時辦公室門被從裡反鎖，阿古情急下破門而入，由此發現了本應交給江戶川柯南小朋友的軟糖獸破裂的屍體。
“對不起，小朋友對不起，我沒有守護好你的夢想，讓你看到這麼難過的一幕，嗷嗷嗚！”
阿古身為數碼世界最受崇拜的數碼寶貝博士，此時卻沒了一點兒德高望重的嚴肅樣兒，江戶川柯南還沒哭，它先哭上了。
“這不是亞古獸博士的錯，錯的是殘忍殺害軟糖獸的兇手。”
江戶川柯南邊安慰邊覺得有點尷尬，他的數碼寶貝又又一次離他而去了，這次甚至還沒來得及見面，對方就成了屍體……數碼世界也會發生兇殺案，見多識廣的名偵探都萬萬沒想到。
阿古很詫異：“兇手？軟糖獸不是自殺的嗎？
