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權力機構的運轉幾乎處於停擺狀態。?
到了他執政晚期，?黨爭事件長期持續，?導致朝政日益腐敗。?與此同時，?他強徵礦稅，?使明朝逐漸走向衰亡。?
此外，?萬曆皇帝在立太子的問題上與眾大臣僵持對立意見，?最終雖被迫立了皇長子朱常洛為太子，?但由此對朝政失去興趣，?更加沉迷於酒色之中?。?
萬曆年間的“東林黨爭”明顯揭示了官僚集團內部的權力鬥爭和明皇朝腐敗現象。?
大明初，由於朱元璋制定的一系列重農抑商，海禁等經濟政策，導致商業發展落後，稅收高度依賴農業，導致財政收入結構單一，風險頻高。
明朝中後期，戰爭與自然災害等諸多原因，所倚靠的農業受到嚴重影響，國家的財政稅收減少，開支卻是越來越大。形成惡性迴圈。
至明朝末年，藍星時空處在了小冰河時期，地球氣溫大幅度下降，天災人禍使得明朝糧食大幅度減產，引發社會劇烈動盪，人口銳減，爆發農民起義，地方割據等問題。導致了社會秩序混亂，皇朝府衙無法有效地控制社會局勢。
加之內外壓力不斷。在與後金的戰爭中，明朝消耗了大量財力和兵力。卻是一敗塗地！
與此同時，朝廷支付出鉅額的遼東軍費，使得國庫日益見底。為了籌集軍費，明朝廷不斷加徵百姓賦稅，致使百姓負擔日鑫加重。財政危機，導致明皇朝無法施行有效的治理國家之策，自加劇了政治腐敗和社會動盪。?
到了明朝末年，土地兼併現象更加嚴重。許多明朝官僚夥同地主，瘋狂擴張兼併土地，導致明朝農民，多是失去賴以生存的土地，陷入一貧如洗狀態。
無地可種的農民，淪為地主佃戶，地主老爺又個個貪婪成性。他們的生活狀況，每況日下。社會矛盾加劇，農民結竿而起，起義浪潮此起彼伏。
明朝從朱棣開始便成立了東廠等特務機構，對官員和百姓進行嚴密的監控，導致社會恐怖風氣蔓延。
後來宦官集團掌控大權，甚至權勢滔天，控制國器，使得明朝後來的皇帝，無法有效治理國家，也是加劇了政治腐敗和社會動盪。
有後世人評論朱翊鈞“明之亡，實亡於神宗”之言。
但朱翊鈞也並非一無是處，其在骨幹朝臣的輔助下，明朝並沒有顯現出明顯的頹態，且明朝萬曆年間先後進行的三次大規模戰役，也都取得了不錯的戰果。
然得民心者，得天下，失民心者，失天下。民眾對明朝官府失去
