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《神農本草經》系統地總結了古代醫家等各方面的用藥經驗，對已經掌握的藥物知識進行了一次全面而系統的整理。
全書共計收錄了365種藥物，正好與一年365日相合，這倒並非巧合，而是作者有意為之的結果。
將365種藥物按照上、中、下分為三類，這被稱為“三品分類法”。分類的依據主要是藥物的效能功效。
上藥一百二十種為君，主養命以應天，無毒，久服不傷人。如人參、甘草、地黃、黃連、大棗等。
中藥一百二十種為臣，主養性以應人，無毒有毒，斟酌其宜。需判別藥性來使用，如百合、當歸、龍眼、麻黃、白芷、黃芩等
下藥一百二十五種為佐使，主治病以應地，多毒，不可久服。如大黃、烏頭、甘遂、巴豆等。
《神農本草經》中也蘊含著豐富而深刻的藥物理論，由此奠定了藥物學的理論構架。
提出了君臣佐使的組方原則。所謂君臣佐使，本為社會中的不同階層成員，有不同的職能與等級，藥物學將其借用來說明藥物在配伍中的不同角色。
如上品藥為君藥，中品藥為臣藥，而下品藥為佐使藥。
在組方時，應該充分考慮藥物的特性，方中既要有君藥、臣藥，還要有起協助作用的佐使之藥。
其比例可按照一君、二臣、三佐、五使或一君、三臣、九佐使的原則來處理。
《神農本草經》中對於所收錄的各種藥物的功效和主治疾病都進行了簡要的記載與描述，這無疑是早期臨床藥學寶貴經驗的總結。
李元本來以為這是一本枯燥的藥草說明書，沒有想到，居然是一本藥物學，類似西醫的藥理學。
藥理學是研究藥物與機體間相互作用規律及其藥物作用機制的一門科學，主要包括藥效動力學和藥代動力學兩個方面。
前者是闡明藥物對機體的作用和作用原理，後者闡明藥物在體內吸收、分佈、生物轉化和排洩等過程，及藥物效應和血藥濃度隨時間消長的規律。
《神農本草經》從“七情和合”的配伍原則出發，講解藥物的相生相剋，對應身體的五行平衡，如何調理，如何針對治療。
李元一口氣讀完，仍覺意猶未盡，強大的腦域已經把所有內容吸收記憶。
意念自動把《神農本草經》和《針灸甲乙經》裡面的知識和理論進行比較、融合，讓他對中醫的理解好似上升了一個臺階。
這種提升讓他幸喜，渴望看到更多的醫
