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寶貝兒！請閉上眼睛，跟著神奇魔法的力量進入魔法世界吧！在世界珠日益繁榮，水晶與夥伴們沉浸於新的魔法探索之際，精靈魔法學院卻陷入了一場前所未有的危機。
三妖后在暗黑魔龍王處鎩羽而歸後，並未放棄她們對魔法世界的統治野心。她們深知，只要水晶和她的夥伴們存在一天，她們的陰謀就難以得逞。於是，三妖后將目光投向了培養眾多魔法精英的精靈魔法學院，企圖從根基上動搖魔法世界的秩序。
三妖后暗中勾結了學院內一些心懷不滿、被黑暗力量誘惑的魔法師，這些叛徒在學院內部悄悄散佈黑暗氣息，蠱惑了部分意志薄弱的學生和教職工。一時間，學院內謠言四起，人心惶惶，原本和諧寧靜的學習與研究氛圍被打破，猜忌與恐懼的陰影籠罩著每一個角落。
魔法學院的守護結界在黑暗力量的侵蝕下逐漸弱化，一些神秘的黑暗生物開始在學院的邊緣地帶出沒。它們身形詭異，散發著腐臭的氣息，所到之處，花草枯萎，牆壁斑駁，彷彿將死亡與衰敗帶到了這片曾經充滿生機的土地。
水晶和她的夥伴們得知學院的危機後，心急如焚。他們迅速趕回學院，決定與三妖后及其爪牙展開一場生死較量。
當水晶踏入學院的那一刻，一股濃烈的黑暗氣息撲面而來。她雖不再有鑲嵌靈珠的魔杖，但體內靈珠的力量與她的意志緊密相連，她目光堅定地說道：“夥伴們，我們不能讓學院毀於一旦，這是我們的家園，也是魔法世界的希望。”
小青渾身雷電環繞，怒吼道：“那些黑暗生物，就交給我來對付，我要讓它們嚐嚐雷電的威力！”說罷，他化作一道藍色的閃電，衝向學院邊緣的黑暗生物群。雷電在他的操控下，如同一把把利刃，瞬間將靠近的黑暗生物劈成灰燼。
小餃子則開啟吞噬魔法，他的身體散發出一股強大的吸力，將那些試圖入侵血院的黑暗氣息紛紛吸入體內。他一邊吞噬，一邊說道：“這些黑暗力量，我會把它們全部淨化！”
小武也不甘示弱，他變大身軀，如同一座移動的堡壘，衝向那些被黑暗力量控制的魔法師。他用堅硬的龜殼抵擋著敵人的攻擊，同時揮動有力的四肢，將靠近的敵人紛紛擊退，為水晶他們開闢出一條前進的道路。
小光則施展出治癒魔法，跟在大家身後，為受傷的夥伴們療傷。她的手中散發出柔和的光芒，光芒所及之處，傷口迅速癒合，疲憊的身軀也重新恢復了力量。
而此時，三妖后在學院深處的遠古祭壇前，念起了邪惡而
