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長伊藤武重拿著印鈔局局長得能良介的鑑定書，秘密地向警視廳川路大警視申請立案並抓捕犯人。川路當即任命佐藤大警部助理為偽鈔案的偵查主任，著手破案。當時，得能局長還提供了一條重要資訊：這種偽鈔在關西地區流通最多。
安藤中警視聽信了得能局長秘密提供的資訊，翌年也就是明治十二年一月派佐藤、奧村兩名大警部助理赴京阪地方調查藤田組與政府要員官商勾結的情況，同時一併調查偽鈔的流通源頭。在此階段，關於藤田組違法經營的秘密調查和關於偽鈔流通源頭的秘密調查沒有併案，是從兩條線分頭進行的。
佐藤和奧村在京阪地方集中精力從一月一直到三月調查偽鈔的來源，但是毫無收穫。兩人轉而想，如果不清楚偽鈔在其他府縣的流通情況，即無法把握偽鈔在全國的流通狀況，要想排查出其流通源頭是件非常困難的事，於是四月便返回東京，向安藤中警視提出在全國範圍內進行調查的建議。
安藤將這個意見向大隈重信大藏卿做了報告，得到許可之後，安藤即會同得能局長、綿貫中警視助理等人召開會議，商討下一步的偵查方向，最後決定奧村大警部助理負責調查東京以北注縣及北海道函館，本田親利中警視負責調查九州各縣，佐藤大警部助理負責調查東海道各縣、京阪地方、四國地方及中國地方，各有專司，即刻前往。
安藤則命中警視擔任起了整個案件調查工作的總指揮，是因為上一年年末的十二月二十八日起，川路大警視出差去了歐洲，考察那裡的警察制度。當時政府希望儘快完成延宕多時的修訂條約、改革警察機構等一系列事項，因而亟須詳盡地瞭解歐洲先進國家的做法為參考。但在一部分人看來，川路的西洋之行，是為了支走這個剛正難弄的人，以便讓藤田組事件不了了之順利過關的計謀。當然也有一種說法，則認為川路遠赴歐洲是為了獲得偽造國幣的有關證據。最初日本的紙幣都是政府委託德國的印刷廠印製，然後再運回日本，後來經過雙方協商訂立協議，德國工廠將銅版印版交給日本，日本則購置了德制的印刷機械和附屬零配件，由大藏省印鈔局在國內印製。因此，川路的歐洲之行除了考察警察制度，似乎也有探尋偽鈔有關證據的目的。
川路在法國巴黎逗留期間宿疾肺病發作，最終死在了歸國途中。由此又引起猜想，說因為川路拿到了藤田組與偽鈔案有關聯的可靠證據，所以被長州藩閥安插在其身邊的人毒殺了。
川路大警視是明治十二年三月上旬抵達巴黎的，去程中就已經發病，到達巴黎後
